南亚果实蝇的危害主要是雌成虫将卵产在新鲜瓜、果表皮下，造成机械损伤，为其他病菌的入侵提供条件；卵在果实内孵化，幼虫取食果肉、果瓤，致使受害瓜果腐烂、脱落。防控措施有1.农业防治，土壤处理、熏杀闷棚、果实套袋、摘除虫果等。2.理化诱控，性信息素诱杀、食诱、黄板、诱蝇球等。3.化学防治，高效氯氟氰菊酯、乙基多杀菌素等。